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题名

G3viz: an R package to interactively visualize genetic mutation data using a lollipop-diagram

作者
通讯作者Ge, Dongliang
发表日期
2020-02
DOI
发表期刊
ISSN
1367-4803
EISSN
1460-2059
卷号36期号:3页码:928-929
摘要

A Summary: The lollipop-diagram is one of the widely used graphical representations to visualize and explore translational effects of genetic mutations in cancer genomics. However, an easy-to-use lollipop-diagram tool with full functionality is still lacking. Here, we introduce g3viz, an R package that enables researchers to explore genetic mutation data using a lollipop-diagram in a web browser. With a few lines of R code, users can interactively visualize data details, annotate findings and export resultant diagrams in high-quality figures. Because of usefulness and usability, g3viz can be generally exploited by researchers with different levels of bioinformatics skills and programming experience.

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收录类别
语种
英语
学校署名
第一 ; 通讯
资助项目
Shenzhen fundamental research fund[JCYJ20180504165657443]
WOS研究方向
Biochemistry & Molecular Biology ; Biotechnology & Applied Microbiology ; Computer Science ; Mathematical & Computational Biology ; Mathematics
WOS类目
Biochemical Research Methods ; Biotechnology & Applied Microbiology ; Computer Science, Interdisciplinary Applications ; Mathematical & Computational Biology ; Statistics & Probability
WOS记录号
WOS:000515095200039
出版者
ESI学科分类
BIOLOGY & BIOCHEMISTRY
来源库
Web of Science
引用统计
被引频次[WOS]:14
成果类型期刊论文
条目标识符http://sustech.caswiz.com/handle/2SGJ60CL/104791
专题创新创业学院
作者单位
1.Southern Univ Sci & Technol, Sch Innovat & Entrepreneurship, Shenzhen 518055, Peoples R China
2.Shenzhen Apostle SUSTECH LTD, Shenzhen 518101, Peoples R China
3.Apostle Inc, Menlo Pk, CA 94025 USA
第一作者单位创新创业学院;  南方科技大学
通讯作者单位创新创业学院;  南方科技大学
第一作者的第一单位创新创业学院
推荐引用方式
GB/T 7714
Guo, Xin,Zhang, Bo,Zeng, Wenqi,et al. G3viz: an R package to interactively visualize genetic mutation data using a lollipop-diagram[J]. BIOINFORMATICS,2020,36(3):928-929.
APA
Guo, Xin,Zhang, Bo,Zeng, Wenqi,Zhao, Shuting,&Ge, Dongliang.(2020).G3viz: an R package to interactively visualize genetic mutation data using a lollipop-diagram.BIOINFORMATICS,36(3),928-929.
MLA
Guo, Xin,et al."G3viz: an R package to interactively visualize genetic mutation data using a lollipop-diagram".BIOINFORMATICS 36.3(2020):928-929.
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文件名称/大小 文献类型 版本类型 开放类型 使用许可 操作
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