题名 | TCR或BCR高通量测序的方法及利用标签序列矫正多重PCR引物偏差的方法 |
发明人 | |
第一发明人 | 徐莹
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申请人 | 南方科技大学
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第一申请人 | 南方科技大学
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第一申请人地址 | 518000 广东省深圳市南山区西丽学苑大道1088号
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当前申请人 | 南方科技大学
; 深圳市瀚海基因生物科技有限公司
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当前申请人地址 | 518000 广东省深圳市南山区西丽学苑大道1088号 (广东,深圳,南山区)
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当前第一申请人 | 南方科技大学
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当前第一申请人地址 | 518000 广东省深圳市南山区西丽学苑大道1088号 (广东,深圳,南山区)
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申请号 | CN201310752881.8
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申请日期 | 2013-12-31
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公开(公告)号 | CN103710454B
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公开日期 | 2016-02-17
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授权日期 | 2016-02-17
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专利状态 | 未缴年费
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法律状态日期 | 2019-12-20
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专利类型 | 授权发明
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学校署名 | 第一
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摘要 | 本发明提供了一种对TCR或BCR进行高通量测序的方法,该方法根据TCR或BCR的V区基因特征设计上游引物,根据TCR或BCR的C区或J区基因特征设计下游引物,结合多重PCR技术和高通量测序,获得TCR或BCR的序列,从而分析TCR或BCR的重排信息;采用本发明提供的2个循环的多重PCR技术,相比现有多重PCR的25~30个循环,能大大降低引物扩增偏好引入的测序误差;此外,本发明还提供了一种利用DNA标签序列矫正多重PCR的引物偏差的方法,进一步降低引物扩增偏好引入的测序误差以及高通量测序固有的测序错误。 |
其他摘要 | The invention provides a method for carrying out high-throughput sequencing on a TCR (T cell receptor) or a BCR (B cell receptor). The method is characterized by designing upstream primers according to gene features of a V region of the TCR or the BCR and designing downstream primers according to gene features of a C region or a J region of the TCR or the BCR and obtaining sequences of the of the TCR or the BCR in combination with the multiplex PCR (polymerase chain reaction) technology and high-throughput sequencing, thus analyzing the rearrangement information of the TCR or the BCR. Compared with 25-30 cycles of existing multiplex PCR, two cycles of the multiplex PCR technology provided by the invention can conduce to greatly reducing the sequencing errors caused by primer amplification preference. Besides, the invention also provides a method for correcting multiplex PCR (polymerase chain reaction) primer deviation by utilizing DNA (deoxyribonucleic acid) tag sequences, thus further reducing the sequencing errors caused by primer amplification preference and intrinsic sequencing errors of high-throughput sequencing. |
CPC分类号 | C12Q1/6869
; C12Q2537/143
; C12Q2535/122
; C12Q2563/185
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IPC 分类号 | C12Q1/68
; C12N15/11
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语种 | 中文
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INPADOC 法律状态 | (-TERMINATION OF PATENT RIGHT DUE TO NON-PAYMENT OF ANNUAL FEE)[2019-12-20][CN]
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INPADOC 同族专利数量 | 1
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扩展同族专利数量 | 1
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专利代理人 | 郝传鑫
; 熊永强
|
代理机构 | 广州三环专利代理有限公司
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相关链接 | [来源记录] |
来源库 | PatSnap
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成果类型 | 专利 |
条目标识符 | http://sustech.caswiz.com/handle/2SGJ60CL/339498 |
专题 | 南方科技大学 |
推荐引用方式 GB/T 7714 |
徐莹,李周芳,童寅,等. TCR或BCR高通量测序的方法及利用标签序列矫正多重PCR引物偏差的方法[P]. 2016-02-17.
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条目包含的文件 | ||||||
文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | 操作 | |
2016.2.17-TCR或BCR高通量(5524KB) | -- | -- | 限制开放 | -- |
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原文链接 |
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