| 题名 | 深圳市3例人感染猪链球菌病原学和基因组学分析 |
| 其他题名 | Pathogenetic and genomic analysis of three cases of Streptococcus suis infection in Shenzhen
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| 作者 | |
| 发表日期 | 2024
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| DOI | |
| 发表期刊 | |
| ISSN | 1009-9727
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| 卷号 | 24期号:3页码:309-314 |
| 摘要 | 目的 对深圳市3例人感染猪链球菌(Streptococcus suis,Ss)分离株进行病原学及基因组学分析,为预防与控制Ss感染疫情提供依据.方法 对3家医院共3名重症患者的3份血平板培养可疑菌株进行生化鉴定、基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱和实时荧光PCR鉴定,获得3株猪链球菌血清2型(Streptococcus suis serotype 2,SS2)阳性菌株.取阳性纯培养物进行药敏试验、提取核酸用于全基因组测序及分析.全基因组序列分析包括物种鉴定、耐药基因比对、多位点序列分型、毒力基因比对和基于coregene的系统进化树分析.结果 3例患者的血平板分离株均鉴定为Ss,VITEK 2生化结果鉴定为SS2,基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱鉴定结果为Ss.Ss通用基因gdh及血清型2型cps2基因实时荧光PCR结果均为阳性.药敏试验结果显示,3株菌均对红霉素、克林霉素耐药,对四环素药敏试验表现出差异.全基因组测序结果发现3株菌物种鉴定均为Ss,包括1株ST7型和2株ST1型.基于VFDB数据库毒力基因预测结果显示,3株菌均为mrp、sly和cps阳性,显示出高毒力株基因特征.基于coregene的系统进化树分析显示,3株菌处于不同进化分支,且ST1型的2株菌进化距离较近.结论 从3名重症患者中均检出SS2,3株菌均对红霉素和克林霉素耐药.在基因组学上均携带有高毒力株所具有的毒力基因,同时在多位点序列分型和系统进化树上表现出差异,表明在深圳地区存在不同基因型的高致病性SS2输入且已引起散发病例,需要引起高度关注. |
| 关键词 | |
| 相关链接 | [万方记录] |
| 语种 | 中文
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| 学校署名 | 其他
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| 资助项目 | No.A2021416:广东省医学科学技术研究基金项目
; No.JCYJ20220531093409021:深圳市科技计划基础研究项目
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| 来源库 | WanFang
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| 万方记录号 | zgrdyx202403014
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| 引用统计 | |
| 成果类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://sustech.caswiz.com/handle/2SGJ60CL/788012 |
| 专题 | 南方科技大学 |
| 作者单位 | 1.深圳市宝安区疾病预防控中心,广东深圳 518101 2.广东医科大学,广东东莞 523830 3.南方科技大学,广东深圳 518055 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 |
陈清凉,赵凌国,王银秋,等. 深圳市3例人感染猪链球菌病原学和基因组学分析[J]. 中国热带医学,2024,24(3):309-314.
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| APA |
陈清凉.,赵凌国.,王银秋.,余光清.,黄光润.,...&雷蕾.(2024).深圳市3例人感染猪链球菌病原学和基因组学分析.中国热带医学,24(3),309-314.
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| MLA |
陈清凉,et al."深圳市3例人感染猪链球菌病原学和基因组学分析".中国热带医学 24.3(2024):309-314.
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| 条目包含的文件 | 条目无相关文件。 | |||||
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